В системе ФМБА России имеется ряд федеральных научно-практических учреждений, которые осуществляют медико-санитарное обеспечение предприятий ядерно-топливного цикла и отдельных территорий. К их числу относятся медико-санитарные части, территориальные управления, центры гигиены и эпидемиологии. Одной из основных задач этих учреждений является обеспечение в пределах своей компетенции безопасности функционирования обслуживаемых предприятий и готовность к действиям в условиях ЧС на предприятиях. Для этих целей в учреждениях имеются подготовленные кадры, материальные ресурсы. Головным учреждением в системе ФМБА России по медицинским проблемам обеспечения безаварийного функционирования предприятий, использующих в технологии радиационный фактор, является Федеральный медицинский биофизический центр им. А. И. Бурназяна (ФМБЦ), созданный на базе ФГУЗ клиническая больница № 6 им. А. И. Бурназяна и ГНЦ «Институт биофизики».
Разработан и прошел экспертизу в Минздравсоцразвития России проект долгосрочной целевой программы «Создание федеральных высокотехнологичных центров медицинской радиологии (2009-2015 гг.)» в трех субъектах Российской Федерации в г. Димитровград Ульяновской области, г. Обнинск Калужской области, г. Северск Томской области. Целью создания Центра ядерной медицины в г. Димитровграде является организация оказания высокотехнологичной медицинской помощи в непосредственной близости от производителя радионуклидов. Впервые в нашей стране в клиническую практику будут внедрены новые, ранее недоступные, методы диагностики и терапии, основанные на использовании коротко - и среднеживущих радионуклидов в соответствии с требованиями мировых стандартов. Основными задачами центра станут: обеспечение высокотехнологичной своевременной радиологической помощью населения; развитие новых технологий радионуклидной диагностики, лучевой терапии и внедрение их в клиническую практику; подготовка высококвалифицированных специалистов по радиационной медицине и медицинской физике.